La grande guerre est enfin finie, l'Alliance a remporté la victoire, enfin, au moins sur le papier. En effet; si l'Akatsuki a été démentelée et si Tobi est décédé, les pièces maîtresses de nombreux villages sont morts. L'individu masqué qui se faisait appeler Tobi a notamment réussi à capturer la raison de la 4ème grande guerre ninja: Naruto Uzumaki; sa capture s'est finie en mort pour le shinobi dans lequel tout le monde plaçait tant d'espoir, par la suite, l'héritier de la famille Uchiwa, Sasuke s'est battu dans un combat à mort avec le fameux Tobi qui perdra la vie au cours du combat; Sasuke finalement mourra de complications après le combat à cause de trop grosses blessures.. Mais aujourd'hui, bien que le monde soit en reconstruction partielle, les différents Kages ne souhaites pas s'appuyer sur l'aide des uns et des autres. Les tentions redeviennent de plus en plus forte ; surtout quand l'akatsuki laisse une trace de son retour...